Nach den Anstrengungen in Frühjahr und Sommer ist das Federkleid der Zwerggans in schlechtem Zustand. Vor dem Vogelzug müssen die alten Federn daher durch neue ersetzt werden. Die Mauser ist eine problematische Zeit für die Zwerggänse, da sie für etwa einen Monat ihre Flugfähigkeit verlieren, bis sich die Flugfedern neu gebildet haben. Während dieser Zeit halten sich die Gänse die meiste Zeit in Ufernähe auf, um bei drohender Gefahr sofort auf das sicherere Wasser zu flüchten.
Die Jungen machen den Wechsel von Dunen zum Federkleid einer erwachsenen Zwerggans durch. Dieser Wechsel ist an die Mauser der Eltern angepasst, sodass alle Vögel gleichzeitig flugfähig werden.