Stabburselva er en variert og fin elv, med gode muligheter for fiske. Det er få store vassdrag i Norge som har et så uberørt preg som Stabburselva. Elva er lakseførende fram til Njakkafossen. Samlet lakseførende strekning er i dag på 27 km. Hoveddelen av Stabburselva ligger innenfor Stabbursdalen nasjonalpark og Stabbursdalen landskapsvernområde. Elva har bestander av både laks, sjøørret og sjørøye.
Stabbursdalen Grunneierforening forvalter Finnmarkseiendommens fiskerettigheter i Stabburselva, i tillegg til sine medlemmers. Stabbursnes Naturhus og Museum selger fiskekort for Stabbursdalen Grunneierforening. På www.stabburselva.info kan du finne informasjon om fiske i Stabburselva.